库区基岩上覆土层分布、渗透性不均匀，不能形成连续分布的防渗体，基岩内岩溶渗漏通道为网络状，局部防渗措施不能解决渗漏问题；又由于岩溶、断层等在基岩中发育深度大，也不能采用垂直防渗措施，因此沟里水库只能采取库底水平防渗结合库岸防渗的型式。库区地形相对平坦，河道比降较小，两岸岸坡高度较低，也适合采取水平防渗，因此本水库采取两布一膜防渗是适宜的，但需注意以下一些问题。库区岩溶发育，且可能随时间加剧发展。勘探遇到溶洞的钻孔数占总钻孔数的12%，局部顶板厚度仅有0.3m，水库蓄水后抬高水头较高，岩溶上部压力增加较多，可能出现岩溶塌陷问题，因此建议对溶洞提前进行灌浆及混凝土充填处理，对顶板厚度小于0.5～1.0m的溶洞，开挖后充填混凝土；对顶板厚度1.0～1.25m的溶洞以及顶板厚5m内无充填物的溶洞，灌水泥浆防止其蓄水后塌陷引起防渗体破坏。水位观测井2000—2015年平均最高地下水位为174.35m，则多年来沟里水库库区最高地下水位低于现状最低库底高程，也低于增容工程库底清淤扩挖最低高程较多，地下水变化区间远离第四系覆盖层，因此地下水变化不会对库区防渗体造成影响。但考虑到汛期地表来水可能很快，沿库岸进入防渗体底部后，来不及下渗补给地下水，从而壅高水位，短时间内呈现承压状态，若防渗体上部重量不足可能造成防渗体上浮破坏，或者造成防渗体垫层冲刷破坏。
